mycoCircAtlas
Pan-Fungal Circular RNA Database ā circRNA predictions for 768 fungal species
768
Fungal Species
406,902
Predicted circRNA Genes (pā„0.85)
3
Taxonomic Groups
15+
Genera Covered
Candida
View
72
Species
41,324
Predicted Genes
Cryptococcus
View
12
Species
4,033
Predicted Genes
Filamentous
View
684
Species
361,545
Predicted Genes
Species Browser
| Species | Common Name | Group | Genus | Predicted Genes |
|---|---|---|---|---|
| Rhizopus microsporus | R. microsporus | Filamentous | Rhizopus | 147 |
| Rhizopus stolonifer | R. stolonifer | Filamentous | Rhizopus | 211 |
| Rhodotorula diobovata | R. diobovata | Filamentous | Rhodotorula | 1,705 |
| Rhodotorula graminis | R. graminis | Filamentous | Rhodotorula | 2,597 |
| Rhodotorula sp. | R. sp. | Filamentous | Rhodotorula | 1,622 |
| Rhodotorula taiwanensis | R. taiwanensis | Filamentous | Rhodotorula | 1,192 |
| Rhodotorula toruloides | R. toruloides | Filamentous | Rhodotorula | 807 |
| Rhynchosporium agropyri | R. agropyri | Filamentous | Rhynchosporium | 278 |
| Rhynchosporium commune | R. commune | Filamentous | Rhynchosporium | 269 |
| Rhynchosporium secalis | R. secalis | Filamentous | Rhynchosporium | 267 |
| Rickenella mellea | R. mellea | Filamentous | Rickenella | 805 |
| Rosellinia necatrix | R. necatrix | Filamentous | Rosellinia | 539 |
| Rutstroemia sp. | R. sp. | Filamentous | Rutstroemia | 384 |
| Saccharomyces boulardii | S. boulardii | Candida | Saccharomyces | 263 |
| Saccharomyces cerevisiae | Baker's yeast | Candida | Saccharomyces | 1,010 |
| Saccharomyces eubayanus | S. eubayanus | Candida | Saccharomyces | 379 |
| Saccharomyces kudriavzevii | S. kudriavzevii | Candida | Saccharomyces | 158 |
| Saccharomyces pastorianus | S. pastorianus | Candida | Saccharomyces | 676 |
| Saccharomycetaceae sp. | S. sp. | Filamentous | Saccharomycetaceae | 32 |
| Saccharomycodes ludwigii | S. ludwigii | Filamentous | Saccharomycodes | 37 |
| Saitoella complicata | S. complicata | Filamentous | Saitoella | 197 |
| Saitozyma podzolica | S. podzolica | Filamentous | Saitozyma | 1,641 |
| Scedosporium apiospermum | S. apiospermum | Filamentous | Scedosporium | 874 |
| Scheffersomyces stipitis | S. stipitis | Candida | Scheffersomyces | 331 |
| Schizophyllum commune | S. commune | Filamentous | Schizophyllum | 776 |
| Schizopora paradoxa | S. paradoxa | Filamentous | Schizopora | 919 |
| Schizosaccharomyces cryophilus | S. cryophilus | Candida | Schizosaccharomyces | 404 |
| Schizosaccharomyces japonicus | S. japonicus | Candida | Schizosaccharomyces | 620 |
| Schizosaccharomyces octosporus | S. octosporus | Candida | Schizosaccharomyces | 422 |
| Schizosaccharomyces pombe | Fission yeast | Candida | Schizosaccharomyces | 1,496 |
| Scleroderma citrinum | S. citrinum | Filamentous | Scleroderma | 677 |
| Sclerotinia borealis | S. borealis | Filamentous | Sclerotinia | 313 |
| Sclerotinia sclerotiorum | S. sclerotiorum | Filamentous | Sclerotinia | 216 |
| Scytalidium lignicola | S. lignicola | Filamentous | Scytalidium | 421 |
| Scytalidium sp. | S. sp. | Filamentous | Scytalidium | 132 |
| Serendipita indica | S. indica | Filamentous | Serendipita | 532 |
| Serendipita vermifera | S. vermifera | Filamentous | Serendipita | 711 |
| Serpula lacrymans | S. lacrymans | Filamentous | Serpula | 565 |
| Sistotremastrum niveocremeum | S. niveocremeum | Filamentous | Sistotremastrum | 702 |
| Sistotremastrum suecicum | S. suecicum | Filamentous | Sistotremastrum | 654 |
| Sodiomyces alkalinus | S. alkalinus | Filamentous | Sodiomyces | 886 |
| Sordaria macrospora | S. macrospora | Filamentous | Sordaria | 791 |
| Sparassis crispa | S. crispa | Filamentous | Sparassis | 771 |
| Spathaspora passalidarum | S. passalidarum | Candida | Spathaspora | 397 |
| Spathaspora sp. | S. sp. | Candida | Spathaspora | 399 |
| Sphaceloma murrayae | S. murrayae | Filamentous | Sphaceloma | 146 |
| Sphaerobolus stellatus | S. stellatus | Filamentous | Sphaerobolus | 719 |
| Sphaerosporella brunnea | S. brunnea | Filamentous | Sphaerosporella | 465 |
| Sphaerulina musiva | S. musiva | Filamentous | Sphaerulina | 388 |
| Sporisorium graminicola | S. graminicola | Candida | Sporisorium | 732 |