mycoCircAtlas

Pan-Fungal Circular RNA Database — circRNA predictions for 768 fungal species

768

Fungal Species

406,902

Predicted circRNA Genes (p≄0.85)

3

Taxonomic Groups

15+

Genera Covered
Candida View
72
Species
41,324
Predicted Genes
Cryptococcus View
12
Species
4,033
Predicted Genes
Filamentous View
684
Species
361,545
Predicted Genes
Species Common Name Group Genus Predicted Genes
Rhizopus microsporus R. microsporus Filamentous Rhizopus 147
Rhizopus stolonifer R. stolonifer Filamentous Rhizopus 211
Rhodotorula diobovata R. diobovata Filamentous Rhodotorula 1,705
Rhodotorula graminis R. graminis Filamentous Rhodotorula 2,597
Rhodotorula sp. R. sp. Filamentous Rhodotorula 1,622
Rhodotorula taiwanensis R. taiwanensis Filamentous Rhodotorula 1,192
Rhodotorula toruloides R. toruloides Filamentous Rhodotorula 807
Rhynchosporium agropyri R. agropyri Filamentous Rhynchosporium 278
Rhynchosporium commune R. commune Filamentous Rhynchosporium 269
Rhynchosporium secalis R. secalis Filamentous Rhynchosporium 267
Rickenella mellea R. mellea Filamentous Rickenella 805
Rosellinia necatrix R. necatrix Filamentous Rosellinia 539
Rutstroemia sp. R. sp. Filamentous Rutstroemia 384
Saccharomyces boulardii S. boulardii Candida Saccharomyces 263
Saccharomyces cerevisiae Baker's yeast Candida Saccharomyces 1,010
Saccharomyces eubayanus S. eubayanus Candida Saccharomyces 379
Saccharomyces kudriavzevii S. kudriavzevii Candida Saccharomyces 158
Saccharomyces pastorianus S. pastorianus Candida Saccharomyces 676
Saccharomycetaceae sp. S. sp. Filamentous Saccharomycetaceae 32
Saccharomycodes ludwigii S. ludwigii Filamentous Saccharomycodes 37
Saitoella complicata S. complicata Filamentous Saitoella 197
Saitozyma podzolica S. podzolica Filamentous Saitozyma 1,641
Scedosporium apiospermum S. apiospermum Filamentous Scedosporium 874
Scheffersomyces stipitis S. stipitis Candida Scheffersomyces 331
Schizophyllum commune S. commune Filamentous Schizophyllum 776
Schizopora paradoxa S. paradoxa Filamentous Schizopora 919
Schizosaccharomyces cryophilus S. cryophilus Candida Schizosaccharomyces 404
Schizosaccharomyces japonicus S. japonicus Candida Schizosaccharomyces 620
Schizosaccharomyces octosporus S. octosporus Candida Schizosaccharomyces 422
Schizosaccharomyces pombe Fission yeast Candida Schizosaccharomyces 1,496
Scleroderma citrinum S. citrinum Filamentous Scleroderma 677
Sclerotinia borealis S. borealis Filamentous Sclerotinia 313
Sclerotinia sclerotiorum S. sclerotiorum Filamentous Sclerotinia 216
Scytalidium lignicola S. lignicola Filamentous Scytalidium 421
Scytalidium sp. S. sp. Filamentous Scytalidium 132
Serendipita indica S. indica Filamentous Serendipita 532
Serendipita vermifera S. vermifera Filamentous Serendipita 711
Serpula lacrymans S. lacrymans Filamentous Serpula 565
Sistotremastrum niveocremeum S. niveocremeum Filamentous Sistotremastrum 702
Sistotremastrum suecicum S. suecicum Filamentous Sistotremastrum 654
Sodiomyces alkalinus S. alkalinus Filamentous Sodiomyces 886
Sordaria macrospora S. macrospora Filamentous Sordaria 791
Sparassis crispa S. crispa Filamentous Sparassis 771
Spathaspora passalidarum S. passalidarum Candida Spathaspora 397
Spathaspora sp. S. sp. Candida Spathaspora 399
Sphaceloma murrayae S. murrayae Filamentous Sphaceloma 146
Sphaerobolus stellatus S. stellatus Filamentous Sphaerobolus 719
Sphaerosporella brunnea S. brunnea Filamentous Sphaerosporella 465
Sphaerulina musiva S. musiva Filamentous Sphaerulina 388
Sporisorium graminicola S. graminicola Candida Sporisorium 732